Biología Computacional
Biología Computacional
Hace unos meses escribí en una entrada de este blog sobre la transición que en ese momento se produjo del antiguo formato de PDB al nuevo, con las ventajas y los consiguientes problemas que ello iba a acarrear. Ayer Guillermo Montoya me contó que justo tenía problemas para abrir PDBs en el formato nuevo con el programa Curves (no sé la versión que está usando), y que sirve para calcular una serie de parámetros sobre un DNA irregular (que no…
Por el lado de Ana Rojas (¡que ya es cinturón negro de Jiu-Jitsu! y que le llegó a su vez por su amigo Andreu) me ha llegado el enlace a una entrada interesante del blog Bioinformatics Zen. En la entrada de ayer Creating a picture of different careers in bioinformatics aparece una encuesta para intentar crear un boceto de las distintas posibles carreras de un@ bioinformátic@. Esta entrada surgió a partir de los comentarios que suscitaron la publicación de The…
Hace unos días, dejó Catalina en una hebra no relacionada la siguiente pregunta: Como sabemos, existen diferentes programas para la visualizacionmolecular tales como el RASMOL y el VMD. Me gustaría saber en qué sediferencian, ya que por lo que he leido son muy parecidos. A nivel básico ambos programas se parecen, pero justo ahí divergen. Rasmol es una herramineta básica que apenas se mantiene hoy en día, pero que ha dejado su huella en el mundo de la bioinformática por…
Much@s de vosotr@s conocereis casos de personas que cambian radicalmente de trabajo o de estilo de vida. Gente que antes trabajaba para la empresa privada entra en el mundo de investigación (algun@s de mis compañer@s), gente del mundo de la investigación decide abandonarlo todo y se pone a viajar por todo el mundo (¿por dónde andarás, Josetxu?), etc.. En el número de este mes de la revista The Scientist aparece una entrevista a Sean Eddy, creador de HMMer. Dentro de…
Recordando la frase de «Johnny 5» en la vieja película «Cortocirtuito 2» ‘Datos, Datos, ¡Más Datos!‘ he creado el título de esta entrada. Los widgets son pequeños trozos de código que proporcionan funcionalidades sencillas, pero necesarias (calculadoras, información meteorológica, vuelos disponibles, etc…), integradas en algún tipo de entorno (escritorios, teléfonos móviles, navegadores, etc…). Por ejemplo ya hay un intento de estandarización de los widgets por parte de la W3C, Google tiene su propio sistema de gadgets para su iGoogle, Yahoo!…
¿Cuántas veces os habeis encontrado con que quereis aprender sobre alguna nueva herramienta que todo el mundo usa, pero que no dominais en absoluto? ¿O tal vez se os resbala un poco una técnica o concepto? Gracias a David G. Pisano (que lo ha encontrado), aquí teneis el enlace al sitio de CLC bio dedicado a Bioinformática. En este sitio podeis encontrar bastantes documentos en PDF escritos en inglés sobre temas como las bases de datos biológicas, comparativas de Blast…
Acabo de enterarme por mi compañero de trabajo Ildefonso Cases que la Fundación Juan March acaba de hacer públicas a través de su página web las grabaciones de audio de todas las conferencias y charlas que desde 1975 se han celebrado allí. Por lo que Ildefonso nos ha contado por correo a mí y al resto de mis compañeros, las grabaciones abarcan toda clase de campos, desde Arte hasta Psicoanálisis, incluyendo un número de charlas sobre Biología Molecular. Por lo…