EURASIP Journal on Bioinformatics and Systems Biology

La noticia de hoy está relacionada con las publicaciones científicas de libre acceso. Me ha llegado hoy de la revista EURASIP Journal on Bioinformatics and Systems Biology un mensaje sobre un «número» especial sobre information theoretic methods (métodos de teoría de la información aplicados al modelado de datos) en bioinformática. Dado el volumen de datos que se maneja actualmente en bioinformática, pienso que el número de métodos y análisis basados en la disciplina de la teoría de la información va…

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BIRD’07

Las vacaciones se están acabando, y los anuncios de nuevos congresos y conferencias de Bioinformática siguen llegando a pesar de que podamos estar en la playa o la montaña, en el extranjero o en el pueblo de nuestros ancestros,o simplemente, de vacaciones. Entre esas conferencias se encuentra BIRD’07 (Bioinformatics Research and Development), que me lo mandó Noura Chebalt a final del mes pasado (¡siento el retraso en anunciarlo!). Seguramente no os sonará el nombre de la conferencia, porque es la…

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Más de 100 Gigabases en las bases de datos públicas de DNA y RNA

Ya hace casi un año (22 de Agosto de 2005) que se alcanzó la astronómica cifra de 100 Gigabases en las bases de datos de DNA y RNA disponibles públicamente para tod@ aquel con espacio para descargarlas (actualmente ¡99 GB de ficheros comprimidos!). Esta compilación de genomas, secuencias y fragmentos de secuencia es debida principalmente al esfuerzo de todos los investigadores de proyectos de secuenciación y a tres entidades coordinadoras: NCBI (National Center for Biotechnology Information, Estados Unidos), EMBL (European…

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ECCB 2006 y los ataques de Israel

La pasada semana me la tomé de vacaciones, y aproveché para descansar, tomar el sol, hacer deporte, … y ver las noticias. Pude comprobar por las imágenes en televisión toda la destrucción provocada por Hezbolá y el ejército de Israel. ¿En qué afecta esto a la bioinformática? Del 10 al 13 de Septiembre se va a celebrar en Eilat, Israel el ECCB 2006 (5th European Conference on Computational Biology). A pique de parecer cotilla, de vuelta de mis mini-vacaciones he…

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Nature: Los 5 blogs de ciencia más populares

Gracias a Gonzalo Gómez, me enteré de que en la última edición de la revista Nature ha salido publicado el artículo titulado «Top five sciences blogs». En él se cuenta que es relativamente raro que los científicos publiquen weblogs, pero aún con esas se ha demostrado que algunos de los existentes son muy populares. Para hacer la estimación de cuáles son los blogs de ciencia más populares primero se rastreó la red en busca de ellos. A continuación, para tener…

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ORC: Open Regulatory Competition

Últimamente parece que lo que publico en este blog tiene que ver competiciones en Bioinformática ¿Será por la llegada del verano y de las competiciones internacionales 😉 ? En esta ocasión, voy a hablar de ORC (Open Regulatory Competition), un sistema diseñado para permitir a los investigadores interesados en transcripción y regulación de genes ejecutar y comparar conjuntos de programas de predicción (de genes, de sitios de transcripción, etc…).

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MODREF 2006

Algunos de vosotros habrá escuchado hablar de competiciones como CASP (Comprehensive Assessment of Structure Prediction), que sirven para comprobar el estado del arte de los métodos de predicción de las distintas características de las estructuras de proteínas (y que este año llega a su séptima edición). Pues bien, si quereis asistir a una reunión donde hay charlas que traten estos temas, pero sin tener que viajar al otro lado del charco, los próximos 3,4 y 5 de Julio se va…

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