Orientación para un projecto relacionado con E. coli de un nuevo bioinformático

Hace un par de días Ángelo escribió pidiendo consejo para abordar un trabajo de investigación que tiene que realizar, paralelo al trabajo de tesis de otras personas. Consiste en identificar una cepa de E.coli (Enterohemorragica) O157: H7 a nivel de genes: el gen que sintetiza la toxina Shiga causante de este mal. Básicamente ha convencido al profesor que coordina esas tesis para realizar de forma paralela la misma tarea conceptual, pero mediante herramientas bioinformáticas (biología in silico), o bien apoyar…

Seguir leyendo >>

Desenredando un nuevo código genético en la mitocondria de los artrópodos

Cuando asisto a congresos y reuniones relacionadas con la bioinformática, pocas veces tengo la oportunidad de encontrar charlas tan interesantes y bonitas como la que impartió Federico Abascal en las JdB2006, titulada ‘Unravelling a new genetic code in the mitochondria of arthropods’. Hablando con él (y aprovechando que lo conozco desde hace mucho y que conoce el blog), le pedí que escribiera un resumen para publicarlo aquí. Os lo incluyo a continuación:

Seguir leyendo >>

Primeras impresiones de las JdB 2006

Hola desde Zaragoza,        tras haber asistido a las primeras charlas de las Jornadas de Bioinformática de este año, puedo afirmar que el nivel general de las ponencias ha aumentado con respecto a los años anteriores. Además, hay oradores invitados de muy alto nivel (como por ejemplo Peer Bork que da mañana su charla o Jeffrey Skolnick, que la ha dado hace un par de horas), más que en los años pasados. El año pasado el nivel fue muy alto, debido…

Seguir leyendo >>

Usando Google Search Engine para buscar tus sitios favoritos de Bioinformática

Hola a tod@s,        como me está pasando últimamente, tengo bastante trabajo acumulado en el laboratorio, y eso influye directamente en el número de entradas que introduzco en el blog. Hace un mes y pico, Jesús Armand Calejero, del blog La paradoja de San Petersburgo, creó mediante Google Co-op un buscador enfocado en sus sitios web favoritos (relacionados con bioinformática). El enlace del buscador es

Seguir leyendo >>

Consultorio de carreras

A principios de este mes que ahora acaba, en el consultorio de carreras de aprendemas.com apareció una consulta de Gabriel Rodríguez sobre la bioinformática como profesión. Ana Arenas escribió la respuesta a esta consulta, y para preparar el contenido publicado estuvo documentándose bastante, usando entre otras fuentes las opiniones y noticias publicadas en este blog. Me parece que la respuesta está muy bien expresada y que puede interesar en general a quien quiera saber qué es necesario para trabajar en…

Seguir leyendo >>

¿Informático o Biólogo?

La gran pregunta de quien está interesad@ en la bioinformática: ¿hay que ser ingenier@ en informática o biólog@ para dedicarse a ésto? La respuesta corta para confudir: «ni lo uno ni lo otro, sino todo lo contrario». En más de una ocasión he publicado en este blog entradas relacionadas de una u otra manera con este dilema, y Juan Antonio Herraiz se está haciendo ahora mismo esa pregunta. Por eso escribió usando el enlace de contacto del blog, cuyo mensaje…

Seguir leyendo >>

G3DATA: cuando perdeis las tablas que generaron unas gráficas

Seguramente en alguna ocasión os habreis encontrado leyendo un artículo científico o un libro interesantísimos con una gráfica espectacular que influye en vuestras investigaciones en curso, y habeis tenido el problema de cómo conseguir la tabla de números que ha generado dicha gráfica, ¿no es verdad? O bien, hace años creasteis u obtuvisteis una gráfica que habeis estado utilizando, pero habeis perdido el método o los datos que usasteis en su momento. Bueno, como muchas veces sucede en la vida,…

Seguir leyendo >>