Bioética y bioinformática

Hola, soy Jesús Armand (calejero.blogspot.com). Llevo un par de semanas viendo que no hay mucho movimiento por tu blog. Te comentaré que ya estamos trabajando en el portal sobre bioinformática. Ya tenemos nombre «Portal hispano de bioinformática». Lo estamos desarrollando con Joomla. También estamos diseñando en logotipo. Hay una propuesta (mía) en mi blog. Por ahora nadie más a mandado ninguna más. Bueno, te quería preguntar si conocías de algún curso online sobre bioética y biotecnología, o similiar. Y, también,…

Seguir leyendo >>

Bioinformatics del 15 de Marzo de 2006, dedicado a minería de datos

Hace un rato he estado echándole un vistazo a número de Bioinformatics del 15 de Marzo, y me he encontrado que el número entero está dedicado a minería de datos en bionformática en todas sus vertientes: análisis de secuencias y de genomas, filogenética, bionformática estructural, expresión génica, biología de sistemas, data & text mining, y un application notes de minería de datos sobre información de genética de poblaciones. Creo que para todos aquellos que trabajamos en minería de datos, ya…

Seguir leyendo >>

Identificación fenotípica de los GPAC en JavaScript

Hace un par de días Joan mandó mediante la opción de contacto el siguiente mensaje: He escrito un javascript para la identificación fenotípica de los GPAC (Gram positive anaerobic cocci) es todavía experimental pero me funciona bastante bien, es GPL.Tal vez no le interese a nadie que se dedique a la bioinformática, pero tal vez a algun microbiólogo si.El programa es una red bayesiana con una modificación difusa para poder aceptar valores positivos débiles. Bueno, personalmente pienso que las pequeñas…

Seguir leyendo >>

Nuevo servicio de The Scientist: The Scientist Careers

Leyendo The Scientist me he encontrado en sus páginas con que han creado un nuevo servicio orientado a la búsqueda de trabajo en el ámbito científico: The Scientist Careers. Por lo que he visto a simple vista, este servicio está más centrado en empleos en Estados Unidos que en otros países, pero aún así os puede ser útil al proporcionar una manera de ver qué se cuece en el ámbito laboral extranjero. Además de la posibilidad de buscar ofertas de…

Seguir leyendo >>

Bases de datos no redundantes

Una de mis funciones actualmente es la de gestionar la descarga y mantenimiento de las bases de datos biológicas del grupo de investigación en el que trabajo. Hace un par de semanas, uno de mis compañeros de trabajo me contó la necesidad que tenían de usar una base de datos no redundante especial, distinta de las publicadas actualmente. En ese momento pensé que podía ser interesante escribir un artículo al respecto, dado que es un tema muy práctico, relacionado con…

Seguir leyendo >>

Búsquedas en la web semántica, bioinformática y Swoogle

En bioinformática, uno de los principales problemas que tenemos es la integración de información, tanto a nivel sintáctico como a nivel semántico. El típico problema sintáctico es, por ejemplo, extraer de las bases de datos PDB, UniProt y RefSeq las secuencias asociadas a cada entrada, traducirlas a la misma notación y almacenarlas. Muchas veces nos olvidamos del problema semántico, simplemente porque, o lo realizamos nosotros de forma inconsciente, o lo consideramos intratable. En el caso del ejemplo anterior, de forma…

Seguir leyendo >>

Google Earth y la gripe aviar

Aunque este weblog es de bioinformática, no me he resistido a la tentación de publicar la siguiente curiosidad, de la que me enteré gracias a Florencio Pazos. Google Earth, la herramienta de sistemas de información geográfica (acrónimo GIS en inglés) de Google está siendo usado de forma cada vez más amplia en el mundo de la investigación. El artículo Virtual Globes: The web-wide world de la revista Nature habla precisamente del uso coordinado de herramientas como Google Earth con imágenes…

Seguir leyendo >>