Cursos online de matemáticas para bioinformátic@s, en alemán

Martin, un compañero de trabajo de origen austriaco, ha realizado el siguiente hallazgo: He encontrado un curso en video (multimedial) online de bioinformática.Esta bien hecho. Tiene todas las clases grabadas en video disponiblesonline (pero está en alemán) He deducido de la página del curso (con mis pobres conocimientos del alemán) que es de matemáticas, cálculo numérico y teoría de la probabilidad para informátic@s y bioinformátic@s. La URL es Para aquell@s que domineis el alemán (obviamente yo no), supongo que…

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Ficheros PDB, ahora también en XML

Hace ya tiempo que los responsables de PDB proporcionaban de forma experimental el contenido de su base de datos en XML, en el denominado formato PDBML. Sin embargo, hasta hace poco no han considerado que estuviera lo suficiente maduro su sistema de consolidación de datos, por  lo que usaban el servidor de proyectos beta de PDB para ello. Hoy en día todas las estructuras almacenadas en PDB se encuentran publicadas en XML en el servidor FTP oficial de PDB, usando…

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Copias congeladas en el tiempo de la base de datos PDB

Acabo de descubrir que los responsables de PDB van a empezar a proporcionar anualmente copias congeladas en el tiempo de su base de datos. El sitio FTP donde se almacenan esas copias es: Actualmente están disponibles dos copias, correspondientes al 6 de Enero de 2005 y 3 de Enero de 2006, y sirven como referencia estable a tod@s aquell@s que trabajeis con estructuras de proteínas. Por ejemplo, a partir de ahora será más fácil saber cuándo un nuevo programa…

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Artículo de La Vanguardia «El país del talento desperdiciado»

Hace unos días salió publicado en el diario La Vanguardia el artículo «El país del talento desperdiciado», y a su vez, en el listado de notas de prensa relacionadas con el CSIC. ¿De qué trata el artículo? De algo que ya conocemos de sobra: que España es una cantera de científicos de un nivel excepcional. Una vez formados, por falta de oportunidades nuestros científicos se van a «pasos más verdes», a países donde tengan más posibilidades y medios para proseguir…

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Nuevo sitio de BioPerl, hospedado por Open Bioinformatics Foundation

David González Pisano me indicó que en NodalPoint.org había aparecido la noticia de la remodelación del sitio web de BioPerl. Alguno se preguntará, «bueno, vale, ¿y qué? Solo han cambiado las páginas, ¿no?». La importancia de esto es que el nuevo sitio web está más orientado a los desarrolladores. Ha sido montado mediante MediaWiki, el mismo software que usa por debajo Wikipedia, con lo cuál el sitio de BioPerl adquiere inmediatamente todas sus virtudes: búsqueda de artículos; creación de artículos…

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Un widget bioinformático para el Dashboard de Mac OS X: ProteinGlimpse

Jaime Fernández Vera, que actualmente está terminando de realizar las prácticas del Máster en Bioinformática de la UCM, nos escribió a Jesús Calejero (y de rebote a mí), para contarnos que está realizando el desarrollo de un widget bioinformático interesante para el DashBoard de Mac OS X. Ana Viñuela me ha informado de la reciente creación de este blog y me parece una excelente idea. ¡Enhorabuena!  🙂 Además quería presentar a todos los lectores de tu web una aplicación que…

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Evolución de los blogs españoles en Bioinformática

Hace unos 20 días Jesús Armand Calejero, el responsable del weblog de bioinformática La paradoja de San Petersburgo, mandó una propuesta a varias personas (entre ellas yo, que por falta de tiempo no contesté :-(, ¡mea culpa!) relacionada con la creación de un gran portal donde pudieran relacionarse y comunicarse tod@s aquell@s relacionad@s con la bioinformática, sin importar la carrera de origen (aquí está la noticia original).

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