Biología Computacional
Biología Computacional
Como en casi cada edición, la fecha de celebración de las Jornadas de Bioinformática se ha desplazado un poco con respecto a la de la anterior. Por ello, las XI Jornadas de Bioinformática se van a celebrar del 23 al 25 de Enero de 2012, en Barcelona. Tal como se puede leer en la página llamando a la participación (el famoso Call for Papers), este año las Jornadas van a dedicar una atención especial a la arquitectura genómica, anotación y…
Es 1 de Agosto, fecha oficial de comienzo de las vacaciones de muchas personas en el mundo. Justo el peor momento para que algo catastrófico le ocurra a vuestro sitio web favorito. ¿Cuántos de vosotros os habéis tirado de los pelos cuando sólo por unos minutos habéis sido incapaces de acceder a vuestras cuentas de GMail, a vuestros perfiles de Facebook, o a la web de vuestro banco? Como dicen los angloparlantes, Shit happens, y la bioinformática no iba a…
Durante estos días estoy asistiendo al ISMB/ECCB 2011, en Viena, Austria, y los dos primeros días no son de congreso como tal, sino dedicados a tutoriales y reuniones de SIGs (Special Interest Groups). En el SIG de CAFA (Critical Assessment on Function Prediction) escuché ayer una charla muy interesante de Amos Bairoch sobre la relación existente entre número de genes y el número de proteínas humanas, sobre UniProt y el proceso de anotación, lo que hay anotado sobre proteínas humanas…
Del 15 al 17 de Septiembre se va a celebrar en Cambridge, Reino Unido, el workshop From Phenotypes to Pathways 2011. Esta reunión forma parte de las reuniones financiadas por el ESF (European Science Foundation), y que forma parte del ESF reseach networking programme (programa de redes de investigación) Frontiers of Functional Genomics. La reunión está dirigida a la inferencia de la arquitectura genética (el mapeo entre el genotipo y los fenotipos de un genoma) a partir de mapeos de…
En este mundo virtual de blogs y podcasts, hace poco se pusieron en contacto conmigo desde RadioSíntesis, una radio dedicada a la ciencia y tecnología. Dicha radio emite por streaming en internet, y que provee los programas ya emitidos en su propio podcast. La razón es que han convocado un concurso llamado «La biotecnología en tu vida», en el que piden que hasta el 10 de Agosto la gente que quiera participar rellene un formulario (en este instante aún no…
Como todo en el mundo de la bioinformática, los formatos de fichero siguen evolucionando. En este caso se trata el formato PDB, que llega a su versión 4.0 . Y con esa nueva versión, toda la base de datos de PDB ha sufrido una revisión profunda para adaptarse al nuevo formato. Dicha revisión se hará pública el próximo 13 de Julio, justo antes del comienzo de las primeras reuniones de ISMB/ECCB 2011. La revisión profunda incluye, por ejemplo, la solución…
RSPerl es un paquete que intenta tender un puente bidireccional entre Perl y R, de forma que desde un programa escrito en Perl se pueda llamar funciones de R, y desde un programa en R se puedan usar código y módulos de Perl. Suena como un sueño, ¿no? Mi compañera de trabajo Kristina estuvo hace unos días intentando instalar RSPerl en la última versión disponible de Ubuntu (11.04, Natty), pero el instalador no terminaba de funcionar (varios errores). Me piqué,…