Récord de simulación de plegamiento de proteínas

Hace unos días salió publicado en Nature News la noticia ‘Supercomputer sets protein-folding record’, en la que se cuenta cómo se ha conseguido simular con el supercomputador Anton los cambios estructurales de una proteína durante un milisegundo, coincidiendo con las observaciones obtenidas de la proteína real. El tiempo necesario para calcular esa simulación fue de 100 días, mientras el tiempo de plegamiento simulado es 100 veces mayor que el anterior récord. Para esta prueba se usaron dos proteínas que han…

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«Science is Vital», proclaman los científicos británicos

Leyendo noticias atrasadas de Slashdot me encontré con la entrada UK Scientists Leave Labs To Protest Expended Cuts, en la que se cuenta brevemente los recortes presupuestarios del 25% que tiene previstos para el próximo año el gobierno del Reino Unido, y un par de enlaces de los intentos de los científicos británicos por alterar ese recorte en el área de ciencia. Uno de estos enlaces es al sitio web Science is Vital, que fue abierto hace más de un…

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Paris japonica y el volumen de los datos

Hoy me he encontrado con una noticia curiosa sobre Paris japonica, una rara flor japonesa, cuyo proyecto de secuenciación ha terminado hace poco. La noticia resalta el tamaño del genoma de esta flor, que es uno de los hechos publicados en el artículo The largest eukaryotic genome of them all?, publicado en Botanical Journal of the Linnean Society. Como no he tenido la oportunidad de leerme el artículo completo (acceso sólo para subscriptores), y la noticia sólo hace referencia al…

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¿Hay demanda de bioinformátic@s a nivel profesional? (año 2010)

Hace 4 años escribí una entrada sobre la demanda profesional de bioinformáticos, en la que hablaba por encima de lo (des)conocida que era la bioinformática, y de la existencia de demanda de bioinformáticos. ¿Qué me ha hecho reflexionar de vuelta sobre el tema? Un mensaje que recibí de Francisco por el panel de mensajes a los bloggers, en el que pide consejo y que os transcribo a continuación: Hola, acabo de terminar ingeniería informática pero siempre he tenido en mente…

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Cuando las señales son muy confusas

En estos últimos días, mientras me dedicaba a partes iguales a lo burocrático y a lo científico, he recibido señales muy confusas sobre la «salud laboral» de la ciencia. Por un lado Elena (muy amiga de Gonzalo, Ángel y Edu) está pendiente de un hilo tras llevar aproximadamente un año buscando trabajo tras la lectura de su tesis. Por otro lado mi vieja amiga Sandra me escribe desde el otro lado del charco para que difunda un par de ofertas…

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Ya queda menos para «La noche de los investigadores»

Hace unos meses me enteré que el 24 de Septiembre se celebra en Madrid «La noche de los investigadores», siguiendo la tradición de La noche de los museos o La noche en blanco (que se celebra el próximo 11 de Septiembre). Todos estos eventos se celebran de forma coordinada en varias ciudades europeas, y en el caso de la noche de los investigadores, es el European Researchers’ Night 2010 (aquí está, por ejemplo, el enlace al que se va a…

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Bioinformática en México

Tras la vuelta de las vacaciones me he encontrado entre los mensajes relacionados con este blog uno escrito por Jacob Israel, en el cuál me habla sobre «Jacob bioinformatics web log», el nuevo blog de bioinformática y de actividades de bioinformática en México que acaba de abrir. Si os preguntáis dónde se hace bioinformática en México, pues por ejemplo en el centro donde trabaja Jacob, el Laboratorio Nacional de Genómica para la Biodiversidad. Una de las principales peculiaridades del blog…

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