Posts etiquetados con ‘genoma’

Proyecto MICROBIOMA: Censando los microbios que viven en el cuerpo

autor: Miguel Vicente

Es sabido, desde ya hace mucho, que de cada diez células que llevamos en el cuerpo tan sólo una es humana, las otras nueve son microbios de diverso tipo. Para ellos nuestro cuerpo es su casa e intentan vivir en armonía desde la piel hasta en el intestino. Hace unos días se ha anunciado la formación de un consorcio mundial de grupos de investigación cuyo objetivo es identificar los microbios que habitan en el ser humano mediante la secuenciación de sus ADNs. Muchos, si no la mayor parte de ellos no se han podido cultivar por lo que se propone una aproximación metagenómica, es decir amplificar los ADNs de origen microbiano que se obtengan del cuerpo, averiguar sus secuencias y por comparación predecir a qué tipo de microbios debe corresponder para finalmente recomponer en el ordenador el catálogo de los minúsculos habitantes del cuerpo humano.


Los sitios que le gustan a los microbios para vivir en el cuerpo humano. La piel, el aparato digestivo, el respiratorio y el urogenital albergan, en el individuo sano, florecientes colonias de muy diversos microbios.


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La domesticación de Penicillium: lectura del genoma del moho productor de penicilina

autor: Miguel Vicente

Alexander Fleming decía que descubrir la penicilina, hace ahora 80 años, no ocurrió porque el moho que la produce le gritase que sintetizaba este antibiótico. Si el moho pudiera hablar probablemente nos diría que tampoco su objetivo en la vida es producir penicilina, pero para nosotros el Penicillium, además de estropear frutas y pan, sirve exactamente para eso. Esta semana se ha publicado en internet la secuencia de su genoma y la comparación de la actividad de sus genes en dos estirpes, siendo una de ellas productora de penicilina en cantidad mucho mayor de lo normal. Podríamos decir que el trabajo cuenta cómo se ha domesticado a un moho.



“El Tercer Hombre”, una historia de tráfico de penicilina. Elprecio de una dosis de penicilina, que en 2004 se vendía a 0,75 €, enlos años cincuenta del pasado siglo era, en valor relativo, de 290 €.La película “El Tercer Hombre” contiene en su trama policíaca crímenesque giran alrededor del entonces lucrativo negocio de “cortar” lapenicilina inyectable con agua.


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¿Por dónde pasa el eje del mal? ¿Seguirá sin aclararse el caso de los ataques de ántrax de 2001?

autor: Miguel Vicente

Acaba de fallecer, al parecer por suicidio, un científico norteamericano a quien se iba a acusar de participar en los ataques de terrorismo biológico que sucedieron a los ataques a las torres gemelas de Nueva York en el otoño de 2001. No parece que esto vaya a ayudar mucho a esclarecer los hechos, pero las primeras  interpretaciones que culpaban a terroristas del “eje del mal” se debilitan más.


Fort Detrick. Logo de las instalaciones norteamericanas de alta seguridad de Fort Detrick en Maryland. Si todo se confirmase el “eje del mal del ántrax” podría haber estado alojado en ellas.

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La carrera del genoma: desde el fago Qbeta al genoma de Watson en menos de 40 años

autor: Miguel Vicente

Pronto será posible llevar la secuencia individual de nuestro genoma en el documento de identidad. Todavía sirve para poco, pero es un primer paso que abrirá las puertas para la medicina individualizada. La técnica se ha usado para secuenciar el genoma de James Watson, codescubridor de la doble hélice, y de un aislado clínico de Francisella tularensis una bacteria patógena del supuesto arsenal bioterrorista.


James Watson básico. Un retrato publicado en el número de Nature en elque se ha publicado la secuenciación del genoma del codescubridor de lala doble hélice.


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¿Las bacterias son arcaicas o son modernas?: la estructura de los tARNs revela una genealogía sorprendente.


autor: Miguel Vicente


El análisis filogenético de los tARNs, que forman parte del complejo sistema de moléculas que traducen el código genético escrito en el ADN al lenguaje de las proteínas, puede producir un vuelco radical en la forma en la que vemos el árbol genealógico de virus, bacterias, arqueas y organismos superiores.


La genealogía de los tARNs. En su conjunto en el panel de arriba ysegún sus dos tipos de estructura en el del centro y abajo. En los trescasos las bacterias aparecen como un linaje joven. Fuente: F-J. Sun andG. Caetano-Anollés, PloS Comp Biol.


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Los científicos ya han sintetizado un genoma, y ahora ¿qué pasa?

autor: Miguel Vicente

La versión en inglés de este artículo se ha publicado en Small things considered “The Microbe Blog”


Dice la noticia que se ha sintetizado el genoma de Mycoplasma genitalium, la bacteria cuyo genoma es el más pequeño de todas las conocidas. El equipo de Craig Venter vuelve a dar titulares. El revuelo que se ha producido recuerda una situación parecida de hace casi once años, el día en que se anunció la existencia de Dolly, la primera oveja clónica. Son resultados que provocan reacciones de todo tipo, científicas, sociales, éticas, sobre todo una vez que han entrado en la cadena de los medios de opinión.



Fragmento del panel central de “El Jardín de las Delicias” de El Bosco. Museo del Prado. Madrid


REFERENCIA
Daniel G. Gibson, Gwynedd A. Benders, Cynthia Andrews-Pfannkoch, Evgeniya A. Denisova, Holly Baden-Tillson, Jayshree Zaveri, Timothy B. Stockwell, Anushka Brownley, David W. Thomas, Mikkel A. Algire, Chuck Merryman, Lei Young, Vladimir N. Noskov, John I. Glass, J. Craig Venter, Clyde A. Hutchison III, Hamilton O. Smith. 2008. Complete chemical synthesis, assembly, and cloning of a Mycoplasma genitalium genome. Science. DOI: 10.1126/science.1151721 .

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10 empollones que están de moda

autor: Miguel Vicente

En su número del 15 de octubre de 2007, la revista Newsweek en su edición internacional entrevista a diez biólogos a los que califica como los 10 biólogos más importantes del siglo 21. Pese a que España sea la 8ª nación en cuanto a sus parámetros económicos, ninguno de ellos trabaja en España ni es español, un detalle que debiera servirnos para templar las frecuentes proclamaciones tanto colectivas como individuales de excelencia científica. Y también para diluir con algo de escepticismo la estética triunfalista de muchas declaraciones de responsables científicos y políticos. La ciencia de nuestro país es la que es, y mientras no se aborde de forma global y contemporánea tardará mucho en superar las carencias y sinsentidos de unas reglas que la administración lo mismo aplica a un roto que a un descosido.

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Categorias: genoma, Prensa

Deja de ser ficción: el transplante de genoma convierte una especie en otra

autor: Miguel Vicente

Un grupo de científicos liderado por el norteamericano J. Craig Venter ha logrado que una bacteria se convierta en otra de una especie diferente. Para ello han transplantado el genoma completo de un Mycoplasma, una bacteria que infecta las células del ganado vacuno provocando un tipo de neumonía, al interior de otra especie que infecta con preferencia a las cabras en las que causa artritis.


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