Los Microorganismos del suelo y su Inmensa Diversidad: Sobre Bacterias, Hongos, Arqueas y Virus

Como veremos posteriormente, y ya indicamos en numerosos post, como el que llevaba el título Bioprospección de Suelos la biodiversidad que atesora el medio edáfico apenas ha sido explorada (que poco sabemos de el mundo que tenemos bajo nuestros pies) , en contra de lo que ocurre con la marina y la de ambientes aun mucho más singulares o exóticos. Ya os comentamos también los numerosos problemas para estimar su biodiversidad . También hemos reiterado que, a falta de taxónomos, comienzan a utilizarse técnicas genómicas y metagenómicas. Expusimos nuestras reservas a la hora de hacer uso de la genómica,  ya que no se debe jamás confundir la riqueza y abundancia de especies con un código de barras genético. Ahora bien, cuando no se quiere vender mala ciencia y se aceptan las limitaciones de estas metodologías, los resultados que pueden aportar son sumamente importantes, y tanto más cuando no hay otros medios, o intereses político-científicos, como para iniciar estudios más profundos de naturaleza taxonómica. Este es el caso de una noticia aparecida en  Sciencedaily, y que llevaba por título: “New Study Suggests Many Unknown Microbes in Soil” (“Nuevos Estudios sugieren que el suelo alberga muchos microbios desconocidos”). La verdad es que este último es, por lo que os hemos contado, un elogio a la trivialidad. Pero no ocurre lo mismo con la noticia en sí, que reproducimos al final del texto en suahili.

 

 

 

Arqueas en suelos boreales forestales

 

La mayor parte la las investigaciones sobre biodiversidad microbiana del medio edáfico se ha centrado en los análisis bacterianos.  Sin embargo, los autores del artículo al que nos referiremos hoy, publicado en la revista American Society for Microbiology han ido mucho más lejos y, mediante análisis metagenómicos del RNA mitocondrial han puesto en evidencia que, al contrario de lo que se presuponía, las bacterias no constituyen la mayor parte de la biodiversidad microbiana del suelo, ni mucho menos. Y eso sí que es una novedad.  Estos investigadores norteamericanos analizaron indirectamente la diversidad de bacterias, arqueas, hongos y virus, demostrando que cualquiera de estos últimos tres grupos taxonómicos resulta ser tanto o más diverso que el primero.

 

 

 

Hongos del Suelo: Aureobasidium pullalans.

 

De tal hallazgo los autores concluyen que, al ocurrir en suelos de ecosistemas tan contrastados como lo son los bosques tropicales, praderas y desiertos, gran parte de la diversidad terrestre del planeta aun es desconocida. Señalamos también que estás técnicas no ofrecen el número real de especies (como otros vendemotos señalan), sino la diversidad relativa entre estos taxa.

 

 

Levaduras del Suelo

 

Más aun, detectaron que la diversidad-variabilidad genómica era completamente distinta en cada una de las muestras analizadas, por lo que no se trata en general de especies ubicuas o cosmopolitas, como otros han llegado a postular sin conocimiento de causa, sino idiosincrásicas de cada muestra de suelo. Del mismo modo, de sus análisis infieren que las comunidades de virus son muy diferentes de las detectadas en otros recursos. Como ya comentamos, la bioprospección de suelos no deparará exclusivamente datos de interés ecológico, sino que será de gran ayuda para la obtención de productos de interés comercial, como nuevos fármacos, entre otros muchos. Tan solo hace falta que los políticos y la comunidad científica actúen guiados por la lógica científica, y no por las modas o los intereses mediáticos, como viene ocurriendo por desgracia.     

 

 

 

Bacteria dot the surface of strands of fungal hyphae.
Credit: R. Campbell. In R. Campbell. 1985.

Plant Microbiology. Edward Arnold; London.

Bacterias sobre hifas de hongos en el suelo

 

 

Virus bacteriofagos (infectan bacterias) del suelo

 

New Study Suggests Many Unknown Microbes in Soil

ScienceDaily (Nov. 12, 2007) Metagenomic analysis of microbial biodiversity in soil samples suggest that non-bacterial species greatly outnumber bacterial species. This means the majority of microorganisms on the Earth remain undiscovered, according to researchers from the University of Colorado, University of South Florida, San Diego State University and Duke University.

Soil microorganisms represent a significant portion of living matter on Earth and play a key role in ecosystem functions. Bacteria, fungi, archaea and viruses are the four microbial groups currently known to man. Bacterial presence in soil has been the most extensively studied, however with the environment at the forefront of worldwide focus, expanded research on fungal, archaeal, and viral communities is much needed.

In the study researchers used an RNA-based analysis technique to examine the richness of bacteria, fungi, archaea, and viruses in samples collected from prairie, desert, and rainforest soils. These sites were specifically targeted because they represent globally dominated ecosystem types and are broad in aridity and productivity. Results showed that unique archaeal or fungal units appeared to rival or exceed unique bacterial units in each of the soil samples.

In this first study, to comprehensively survey rival communities using a metagenomic approach, we found that soil viruses are taxonomically diverse and distinct from the communities of viruses found in other environments that have been surveyed using a similar approach,” say the researchers. “Within each of the four microbial groups, we observed minimal taxonomic overlap between sites, suggesting that soil archaea, bacteria, fungi, and viruses are globally as well as locally diverse.”

Journal reference: N. Fierer, M. Breitbart, J. Nulton, P. Salamon, C. Lozupone, R. Jones, M. Robeson, R.A. Edwards, B. Felts, S. Rayhawk, R. Knight, F. Rohwer, R.B. Jackson. 2007. Metagenomic and small-subunit rRNA analyses reveal the genetic diversity of bacteria, archaea, fungi, and viruses in soil. Applied and Environmental Microbiology, 73. 21: 7059-7066.

Adapted from materials provided by American Society for Microbiology, via EurekAlert!, a service of AAAS.

 Post previos sobre biodiversidad del suelo

Que Poco Sabemos del Suelo: ¿Cuales son los Organismos más Grandes del Mundo?

Aspectos Generales de la Biología y Biodiversidad del Suelo

Problemas para Estimar la Biodiversidad del Suelo

Los Suelos: Banco de Semillas “in situ” por Antonomasia

La Rizosfera: Universos Dentro de Universos

El Asombroso Entramado de la Vida en los Suelos

Individuos y Ecosistemas o Individuos-Ecosistemas: la Ambigüedad de la Vida y la Importancia del Suelo

Clasificación de los Organismos del Suelo por Tamaños

Diversidad y Escalas en Biota y Suelos

Contraste Taxonómico y Diversidad

Biodiversidad y El Código de Barras Genético: ¿Científicos o Comerciantes?

Genómica y Suelos: ¿Una Revolución?

Bioprospección de Suelos, Enfermedades Intrahospitalarias y Biocombustibles

Comunidades Microbianas del Suelo: Relaciones Biodiversidad-Área

¿Cuál es el Grupo Taxonómico más Diversificado del Mundo?

Diversidad de Sustratos, Diversidad de Hábitats y Biodiversidad

 

 

 

Juan José Ibáñez

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Comentarios

que me parese muy chebre que hicieran un proyecto para cuidar el medio ambiente por que eso lo mas sagraso que tenemos por que cuando se acabe el agua todos vamos a morir lo unico que yo dijo es que conservemos el medio ambiente.

ta muy interesante

Yo tengo un cultivo de la segunda y tercera imagen, son venenosos por contacto aereo, o sea, las esporas que aspiras no hacen nada no??

es muy interesante seber que bacterias tiene el suelo como tal por quie es muy importante

me parese es muy interesante su tema y tiene temas de mucho interes

es muy interesante, pero deben existir mas planes para la realizacioon de proyectos sobre los microorganismos del suelo, ya que su microbiología es muy amplia y podemos encontrar algún beneficio para su posterior utilizacion en la Biotecnología

Great post and straight to the point. I don’t know if this is truly the best place to ask but do you guys have any thoughts on where to employ some professional writers? Thanks in advance :)

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[...] más acerca de las estrellas del cielo nocturno que acerca de suelo bajo nuestros pies, con la diferencia que las estrellas son intocables pero al suelo, o sus [...]

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