Las Bacterias del Suelo Generan las Infecciones Multiresistentes y la Mayoría de las Infecciones Nosocomiales

No somos adivinos, sino que hablamos con colegas y empleamos el sentido común. Abajo os dejo un amplio repertorio de post en los que ya advertimos que el uso del suelo  como vertedero deviene en uno de los peores problemas de salud pública que aqueja a la humanidad. Como los lectores más asiduos recordarán, ciertas investigaciones y las conversaciones entre mi hermana, Consuelo Ibáñez, la administradora del blog  Salud Pública y Algo Más, nos llevaron a lanzar la conjetura de que los microrganismos del suelo, mediante su flujo horizontal de genes, debían ser los causantes de problemas sanitarios tan graves como el crecimiento exponencial de la resistencia a antibióticos, enfermedades nosocomiales o infecciones intrahospitalarias y bacterias multiresistentes. Todo ello ha sido confirmado recientemente por un equipo de investigadores en un articulo de la revista Science. Sorprende que la prensa general Española apenas publicitara este importante hallazgo al contrario que la Latinoamericana. ¿Por qué? Prefiero callarme. En la carrera armamentística entre los microrganismos patógenos y la especie humana tenemos todas las de perder. Empero como ya os comentamos, esos bichitos son por lo general nuestros amigos. Sin ellos los individuos pertenecientes a la mayor parte de las especies multicelulares no podríamos vivir.  Ahora bien, esta Smart Society se encuentra arruinando nuestro ambiente y nuestra salud, induciendo adicionalmente este enorme problema de salud pública que ha causado ya cientos de miles de fallecimientos y lo seguirá haciendo hasta que se cuenten por millones. La agroindustria y la agricultura/ganadería industrial (con el abuso de antibióticos) son en gran parte responsables del problema, que no de la solución como alegan los irredentos tocagenes defensores de los transgénicos (dejáramos hoy a la farmaindustria al margen, aunque también está implicada). Nuestra economía tecnológica puede estar causando más padecimientos que bienestar a una buena parte de los ciudadanos de esta mugrienta aldea global. Empero en esta ocasión, ni tan siquiera incluimos los devastadores efectos de la contaminación ambiental, o del reciclado de juguetitos electrónicos en los países del tercer mundo. De hacerlo el problema sería tan grave como para considerar a nuestras prácticas tecnosociales el principal enemigo de la especie humana. Se trata de un análisis al que ningún valiente, ya sea persona o institución, desea enfrentarse. Y no somos catastrofistas. Basta para comprobarlo, sumar las causas de morbilidad y mortalidad que publican anualmente organismos internacionales como la FAO; OMS, ONU, etc. ¡Cuestión de sumar, que no de ciencia!. Los datos y narraciones  que os hemos ofrecido ya dan cuenta que no atesoramos el don de la adivinación: basta con utilizar la cabeza “un poco”. La noticia muy clara y precisa que os ofrecemos hoy, no deja lugar a dudas. Resulta paradójico, por ejemplo, que esos microrganismos que dan el olor del suelo húmedo  se encuentren dentro de esta ecuación, cuando la basura humana, el estiércol y purines,  o los residuos sólidos urbanos son esparcidos en el suelo en aras de la producción industrial de alimentos. ¡llueve sobre mojado!. Hablamos del resistoma (nuevo vocablo para un viejo problema). ¿Que es?. Abajo damos cuenta de ello. Tan solo rogar que entendamos de una vez por todas que o cuidamos los suelos o enfermaremos por ello. Comenzaremos dando cuenta de los post que hemos escrito a cerca de este tema, para seguidamente exponeros la noticia, y el resumen de la investigación original. Nos venden por progreso  lo que nos está matando. Somos bobos, producto de la bobalización socio/política/económica. ¡No hay más!. Eso si, por mucho que damos en la diana no recibiremos premios por cuanto a los poderes fácticos no les gustan nuestras ¡adivinanzas!.

streptomiices

Streptomyces. Microrganismos del suelo. Fuente: DiCYT

Juan José Ibáñez

Post previos editados sobre el tema

Suelos y Bacterias Resistentes a los Antibióticos

La Seguridad Alimentaria por los Suelos: Guerra Biológica, Agro-Farma-Industria, Bacterias Multiresistentes, y Enfermedades nocosomiales.

La Rápida Coevolución Bacterias-Virus: Repercusiones Sobre la Estructura de las Comunidades Microbianas del Suelo.

La Seguridad Alimentaria por los Suelos: Guerra Biológica, Agro-Farma-Industria, Bacterias Multiresistentes, y Enfermedades nocosomiales

Lodos de Depuradora, Fertilización, Contaminación Biológica y Bacterias Resistentes a los Antibióticos

Los Suelos de los márgenes de las carreteras, autopistas para las bacterias multiresistentes a los antibióticos.

Minería Genómica, Microorganismos del Suelo y Antibióticos

Bacterias en el suelo se vuelven más resistentes: Estudio

Las bacterias en el suelo y las que enferman a los humanos intercambian rápidamente genes con resistencia a múltiples medicamentos y contribuyen a la creciente ineficacia de los antibióticos, según un artículo que publica hoy la revista Science. El equipo investigador lo encabezó Kevin Forsberg, del Centro para Ciencias del Genoma y Biología de sistemas en la Escuela de Medicina de la Universidad Washington, en St. Louis, Missouri. Las conclusiones de este estudio podrían modificar el enfoque que actualmente prevalece acerca de la resistencia bacterial a los antibióticos, y las formas de combatirla.

El suelo terrestre es uno de los hábitat más grandes y más diversos en el planeta, señalaron los investigadores, y “los microbios del suelo representan uno de los antiguos orígenes evolucionarios de la resistencia a los antibióticos” . Esos microbios, agrega el artículo, se han señalado como “un reservorio de genes de resistencia disponibles para el intercambio con los patógenos clínicos“. “La continua evolución y la amplia propagación de genes de resistencia a los antibióticos en los patógenos humanos es un problema clínico de la mayor importancia”, explicaron los autores.

Los suelos tienen un extenso contacto directo con los antibióticos que se usan en la crianza de ganado y en la agricultura, y son asimismo el hábitat natural de las bacterias Stretomyces, cuya especie representa la mayoría de todos los antibióticos producidos naturalmente. Las bacterias del género Streptomyces, el más extenso entre las actinobacterias, se encuentran predominantemente en suelos y en la vegetación descompuesta, y su presencia se distingue por el “olor a tierra húmeda” que resulta de su producción de un metabolito volátil, la geosmina.
Forsberg y sus colegas emplearon la secuencia metagenómica para identificar a siete genes de resistencia en las bacterias del suelo de granjas que comparten una identidad perfecta con los genes de resistencia en varias cepas de las bacterias Salmonella, Klesbsiella pneumoniae y otros patógenos. También encontraron que los genes de resistencias múltiples se encuentran agrupados y flanqueados por elementos móviles del ácido desoxirribonucleico que, se sabe, permiten la transferencia de genes entre las bacterias. “El intercambio de resistencia entre el suelo y los patógenos enfatiza la importancia clínica del resistoma del suelo, independientemente de si los genes de resistencia pasan del suelo a la clínica o viceversa“, agregó el artículo.

Resistoma es el término que emplean los biólogos para referirse a la colección de todos los genes de resistencia a los antibióticos y sus precursores en las bacterias tanto patógenas como no patógenas. “La transmisión del suelo a la clínica establece al suelo como la fuente directa de los genes de resistencia en los patógenos”, señaló el estudio. “El movimiento de la resistencia de los patógenos al suelo significa que los patógenos pueden transferir la resistencia a los organismos en el suelo, muchos de los cuales pueden causar infecciones nosocomiales (adquiridas en el hospital) y pueden emerger como patógenos” .

Los resultados, añadió Science, indican que la contaminación del suelo y el agua con los desechos que contienen altos niveles de antibióticos, como asimismo el uso excesivo de antibióticos en la crianza del ganado, probablemente contribuyen a la selección de genes de resistencia a los antibióticos en las bacterias presentes en el ambiente.

01/09/2012 – 18:48:54

Por: EFE y El Universal.

Bacterias del suelo se hacen resistentes

El suelo terrestre es uno de los hábitats más grandes del mundo por lo que representa uno de los factores evolucionarios de la resistencia a antibióticos. Los suelos tienen contacto directo con los antibióticos que se usan en la crianza de ganado y en la agricultura.

Domingo 02 de septiembre de 2012EFE | El Universal01:01

Las bacterias en el suelo y las que enferman a los humanos intercambian rápidamente genes con resistencia a múltiples medicamentos y contribuyen a la creciente ineficacia de los antibióticos, según un artículo que publica hoy la revista

Lee el artículo original en inglés (el resumen, por cuento el trabajo es de pago).

gpdm

Resumen del Artículo Original en Science:

Science 31 August 2012: Vol. 337 no. 6098 pp. 1107-1111
DOI: 10.1126/science.1220761

The Shared Antibiotic Resistome of Soil Bacteria and Human Pathogens

Kevin J. Forsberg,  Alejandro Reyes, Bin Wang, Elizabeth M. Selleck, Morten O. A. Sommer, Gautam Dantas

Abstract

Soil microbiota represent one of the ancient evolutionary origins of antibiotic resistance and have been proposed as a reservoir of resistance genes available for exchange with clinical pathogens. Using a high-throughput functional metagenomic approach in conjunction with a pipeline for the de novo assembly of short-read sequence data from functional selections (termed PARFuMS), we provide evidence for recent exchange of antibiotic resistance genes between environmental bacteria and clinical pathogens. We describe multidrug-resistant soil bacteria containing resistance cassettes against five classes of antibiotics (β-lactams, aminoglycosides, amphenicols, sulfonamides, and tetracyclines) that have perfect nucleotide identity to genes from diverse human pathogens. This identity encompasses noncoding regions as well as multiple mobilization sequences, offering not only evidence of lateral exchange but also a mechanism by which antibiotic resistance disseminates.

Received for publication 20 February 2012. Accepted for publication 22 June 2012.

The Shared Antibiotic Resistome of Soil Bacteria and Human Pathogens

Soil microbiota represent one of the ancient evolutionary origins of antibiotic resistance and have been proposed as a reservoir of resistance genes available for exchange with clinical pathogens. Using a high-throughput functional metagenomic approach in conjunction with a pipeline for the de novo assembly of short-read sequence data from functional More

Science 31 August 2012: Vol. 337 no. 6098 pp. 1107 1111DOI:10.1126/science.1220761

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